В список «экстремистов» попала не само государственное учреждение — Мемориальный музей‑заповедник истории политических репрессий «Пермь‑36», а автономная некоммерческая организация, которая в прошлом создала и управляла музеем, но была отстранена от управления местными властями.
Директор музея Наталия Семакова пояснила, что в реестр внесли именно прежнюю НКО, а не нынешнее юридическое лицо учреждения.
По её словам, организация существовала около десяти лет и была ликвидирована примерно в 2015 году; руководители той структуры позже зарегистрировали аналогичную организацию за рубежом, поэтому сейчас у музея прямых связей с этой НКО нет.
По данным музея, его полное юридическое название — Государственное бюджетное учреждение культуры Пермского края «Мемориальный музей‑заповедник истории политических репрессий «Пермь‑36»; в реестр Росфинмониторинга же попала Автономная некоммерческая организация «Мемориальный центр истории политических репрессий «Пермь‑36».
НКО была основана в 2001 году, именно она создала музей и руководила им до середины 2010‑х. Затем комплекс перешёл под контроль местных властей: создали новую государственную организацию, которой передали имущество бывшего лагеря, архивы, библиотеку и экспозиции. Консультантами госучреждения стали бывшие сотрудники пенитенциарной службы. В 2015 году ту НКО признали иностранным агентом, а в 2016‑м ликвидировали.
В 2023 году за пределами России открыли виртуальную версию музея с похожим названием; проект проработал около года, в настоящее время его страницы и сайт неактивны. В 2025 году один из участников оригинальной команды, Виктор Шмыров, скончался.